MARC状态:审校 文献类型:中文图书 浏览次数:15
- 题名/责任者:
- DNA和蛋白质序列数据分析工具/薛庆中,等编著
- 版本说明:
- 3版
- 出版发行项:
- 北京:科学出版社,2012
- ISBN及定价:
- 978-7-03-034509-7/CNY75.00
- 载体形态项:
- 356页;24cm
- 丛编项:
- 生物信息学数据分析丛书
- 个人责任者:
- 薛庆中 编著
- 学科主题:
- 脱氧核糖核酸-数据-分析
- 中图法分类号:
- Q523
- 提要文摘附注:
- 本书分8章,第1章,阐述序列比较的核心方法,即运用BLAST和ClustalX等工具做序列比对;第2章重点介绍了核苷酸序列分析工具,主要包括:基因预测,编码区结构分析,可变剪切分析,预测基因启动子,基因调控元件预测,密码子的偏好性分析等;第3章,蛋白质氨基酸序列分析从搜索数据库开始,随后对蛋白质基本理化性质、二级结构、结构域和三维空间结构、预测目标蛋白的生物功能等工具进行逐一介绍。第4章,使用TM4软件可实现芯片的数据采集,低质量过滤,标准化处理。GenMAPP软件则有助于挖掘芯片数据在代谢途径中的生物学意义。第5章,简介GeneOntology和KEGG数据库,将分别有助于挖掘基因和蛋白的功能及其代谢途径分析。第6章,介绍分子进化遗传分析工具包,用MEGA4绘制系统发生树,为研究基因进化打好基础。第7章,利用X!Tandem软件鉴定蛋白质的串联质谱数据,再将质谱结果匹配到蛋白质组数据库鉴定出蛋白;借助TPP软件包进行统计学分析,优化检索结果。第8章,介绍Cytoscape系统生物学分析软件,展示蛋白-蛋白相互作用,并实现与基因表达等数据有机整合。书后附有专业词索引。
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